Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CREB1P16220 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CREB1P16220 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CREB1P16220 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CREB1P16220 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CREB1P16220 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CREB1P16220 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CREB1P16220 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CREB1P16220 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CREB1P16220 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CREB1P16220 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CREB1P16220 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CREB1P16220 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CREB1P16220 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CREB1P16220 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CREB1P16220 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CREB1P16220 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CREB1P16220 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CREB1P16220 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CREB1P16220 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CREB1P16220 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CREB1P16220 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CREB1P16220 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CREB1P16220 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB1P16220 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB1P16220 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB1P16220 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB1P16220 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB1P16220 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB1P16220 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB1P16220 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB1P16220 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB1P16220 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB1P16220 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB1P16220 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CREB1P16220 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CREB1P16220 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CREB1P16220 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CREB1P16220 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CREB1P16220 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CREB1P16220 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CREB1P16220 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CREB1P16220 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CREB1P16220 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CREB1P16220 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CREB1P16220 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CREB1P16220 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CREB1P16220 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CREB1P16220 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CREB1P16220 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CREB1P16220 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CREB1P16220 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CREB1P16220 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CREB1P16220 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CREB1P16220 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CREB1P16220 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CREB1P16220 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CREB1P16220 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CREB1P16220 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CREB1P16220 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CREB1P16220 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CREB1P16220 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CREB1P16220 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CREB1P16220 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CREB1P16220 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB1P16220 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB1P16220 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB1P16220 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB1P16220 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB1P16220 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB1P16220 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB1P16220 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB1P16220 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB1P16220 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB1P16220 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CREB1P16220 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CREB1P16220 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CREB1P16220 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CREB1P16220 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CREB1P16220 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CREB1P16220 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB1P16220 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB1P16220 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB1P16220 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB1P16220 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB1P16220 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB1P16220 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB1P16220 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB1P16220 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB1P16220 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB1P16220 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB1P16220 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB1P16220 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CREB1P16220 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CREB1P16220 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CREB1P16220 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CREB1P16220 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CREB1P16220 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CREB1P16220 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CREB1P16220 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms