Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CREB1P16220 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CREB1P16220 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CREB1P16220 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CREB1P16220 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CREB1P16220 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CREB1P16220 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CREB1P16220 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CREB1P16220 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CREB1P16220 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CREB1P16220 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CREB1P16220 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CREB1P16220 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CREB1P16220 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CREB1P16220 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CREB1P16220 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CREB1P16220 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CREB1P16220 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CREB1P16220 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CREB1P16220 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CREB1P16220 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CREB1P16220 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CREB1P16220 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CREB1P16220 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB1P16220 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB1P16220 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB1P16220 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB1P16220 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB1P16220 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB1P16220 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB1P16220 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB1P16220 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB1P16220 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB1P16220 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB1P16220 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CREB1P16220 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CREB1P16220 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CREB1P16220 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CREB1P16220 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CREB1P16220 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CREB1P16220 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CREB1P16220 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CREB1P16220 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CREB1P16220 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CREB1P16220 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CREB1P16220 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CREB1P16220 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CREB1P16220 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CREB1P16220 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CREB1P16220 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CREB1P16220 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CREB1P16220 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CREB1P16220 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CREB1P16220 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CREB1P16220 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CREB1P16220 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CREB1P16220 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CREB1P16220 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CREB1P16220 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CREB1P16220 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CREB1P16220 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CREB1P16220 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CREB1P16220 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CREB1P16220 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CREB1P16220 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB1P16220 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB1P16220 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB1P16220 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB1P16220 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB1P16220 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB1P16220 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB1P16220 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB1P16220 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB1P16220 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB1P16220 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CREB1P16220 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CREB1P16220 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CREB1P16220 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CREB1P16220 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CREB1P16220 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CREB1P16220 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB1P16220 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB1P16220 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB1P16220 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB1P16220 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB1P16220 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB1P16220 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB1P16220 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB1P16220 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB1P16220 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB1P16220 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB1P16220 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB1P16220 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CREB1P16220 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CREB1P16220 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CREB1P16220 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CREB1P16220 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CREB1P16220 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CREB1P16220 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CREB1P16220 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms