Protein–RNA interactions for Protein: P15313

ATP6V1B1, V-type proton ATPase subunit B, kidney isoform, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1B1P15313 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP6V1B1P15313 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP6V1B1P15313 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP6V1B1P15313 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6V1B1P15313 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6V1B1P15313 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6V1B1P15313 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6V1B1P15313 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6V1B1P15313 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6V1B1P15313 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6V1B1P15313 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6V1B1P15313 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6V1B1P15313 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6V1B1P15313 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6V1B1P15313 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6V1B1P15313 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V1B1P15313 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V1B1P15313 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V1B1P15313 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V1B1P15313 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V1B1P15313 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V1B1P15313 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V1B1P15313 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V1B1P15313 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V1B1P15313 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V1B1P15313 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V1B1P15313 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V1B1P15313 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1B1P15313 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1B1P15313 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1B1P15313 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1B1P15313 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1B1P15313 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1B1P15313 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1B1P15313 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1B1P15313 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1B1P15313 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1B1P15313 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1B1P15313 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1B1P15313 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1B1P15313 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1B1P15313 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1B1P15313 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V1B1P15313 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V1B1P15313 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V1B1P15313 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP6V1B1P15313 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP6V1B1P15313 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP6V1B1P15313 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V1B1P15313 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V1B1P15313 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms