Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LYL1P12980 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LYL1P12980 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LYL1P12980 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LYL1P12980 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LYL1P12980 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LYL1P12980 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LYL1P12980 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LYL1P12980 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LYL1P12980 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LYL1P12980 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LYL1P12980 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LYL1P12980 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LYL1P12980 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LYL1P12980 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LYL1P12980 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LYL1P12980 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LYL1P12980 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LYL1P12980 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LYL1P12980 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LYL1P12980 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LYL1P12980 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LYL1P12980 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LYL1P12980 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LYL1P12980 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LYL1P12980 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LYL1P12980 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LYL1P12980 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LYL1P12980 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LYL1P12980 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LYL1P12980 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LYL1P12980 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LYL1P12980 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LYL1P12980 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LYL1P12980 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LYL1P12980 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LYL1P12980 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LYL1P12980 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LYL1P12980 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LYL1P12980 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LYL1P12980 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LYL1P12980 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LYL1P12980 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LYL1P12980 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LYL1P12980 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LYL1P12980 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LYL1P12980 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LYL1P12980 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LYL1P12980 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LYL1P12980 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LYL1P12980 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LYL1P12980 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LYL1P12980 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LYL1P12980 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LYL1P12980 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LYL1P12980 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LYL1P12980 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LYL1P12980 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LYL1P12980 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LYL1P12980 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LYL1P12980 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LYL1P12980 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LYL1P12980 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LYL1P12980 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LYL1P12980 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LYL1P12980 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LYL1P12980 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LYL1P12980 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LYL1P12980 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LYL1P12980 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LYL1P12980 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LYL1P12980 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LYL1P12980 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LYL1P12980 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LYL1P12980 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LYL1P12980 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LYL1P12980 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LYL1P12980 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LYL1P12980 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LYL1P12980 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LYL1P12980 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LYL1P12980 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LYL1P12980 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LYL1P12980 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LYL1P12980 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LYL1P12980 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LYL1P12980 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LYL1P12980 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LYL1P12980 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LYL1P12980 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LYL1P12980 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LYL1P12980 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LYL1P12980 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LYL1P12980 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LYL1P12980 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LYL1P12980 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LYL1P12980 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LYL1P12980 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LYL1P12980 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LYL1P12980 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms