Protein–RNA interactions for Protein: P10828

THRB, Thyroid hormone receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRBP10828 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
THRBP10828 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
THRBP10828 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
THRBP10828 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
THRBP10828 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
THRBP10828 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
THRBP10828 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
THRBP10828 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
THRBP10828 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
THRBP10828 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
THRBP10828 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
THRBP10828 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
THRBP10828 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THRBP10828 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THRBP10828 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
THRBP10828 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
THRBP10828 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
THRBP10828 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THRBP10828 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THRBP10828 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THRBP10828 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THRBP10828 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THRBP10828 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
THRBP10828 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THRBP10828 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THRBP10828 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THRBP10828 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
THRBP10828 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
THRBP10828 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
THRBP10828 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THRBP10828 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THRBP10828 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THRBP10828 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THRBP10828 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THRBP10828 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THRBP10828 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THRBP10828 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THRBP10828 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THRBP10828 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THRBP10828 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THRBP10828 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THRBP10828 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THRBP10828 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THRBP10828 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
THRBP10828 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THRBP10828 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THRBP10828 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THRBP10828 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THRBP10828 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THRBP10828 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
THRBP10828 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THRBP10828 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THRBP10828 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
THRBP10828 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THRBP10828 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THRBP10828 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
THRBP10828 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THRBP10828 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THRBP10828 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
THRBP10828 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
THRBP10828 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
THRBP10828 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THRBP10828 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THRBP10828 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THRBP10828 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THRBP10828 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THRBP10828 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THRBP10828 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THRBP10828 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THRBP10828 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THRBP10828 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THRBP10828 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THRBP10828 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THRBP10828 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THRBP10828 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THRBP10828 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THRBP10828 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THRBP10828 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THRBP10828 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THRBP10828 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THRBP10828 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THRBP10828 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THRBP10828 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THRBP10828 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THRBP10828 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THRBP10828 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THRBP10828 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
THRBP10828 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THRBP10828 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THRBP10828 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THRBP10828 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THRBP10828 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THRBP10828 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THRBP10828 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THRBP10828 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THRBP10828 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THRBP10828 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
THRBP10828 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THRBP10828 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THRBP10828 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms