Protein–RNA interactions for Protein: P09012

SNRPA, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPAP09012 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNRPAP09012 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNRPAP09012 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNRPAP09012 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNRPAP09012 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNRPAP09012 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNRPAP09012 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNRPAP09012 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNRPAP09012 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNRPAP09012 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNRPAP09012 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNRPAP09012 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNRPAP09012 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNRPAP09012 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNRPAP09012 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNRPAP09012 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNRPAP09012 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNRPAP09012 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNRPAP09012 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNRPAP09012 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNRPAP09012 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNRPAP09012 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNRPAP09012 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNRPAP09012 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SNRPAP09012 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNRPAP09012 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNRPAP09012 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNRPAP09012 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNRPAP09012 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNRPAP09012 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNRPAP09012 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNRPAP09012 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNRPAP09012 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNRPAP09012 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNRPAP09012 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNRPAP09012 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNRPAP09012 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNRPAP09012 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNRPAP09012 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNRPAP09012 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SNRPAP09012 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNRPAP09012 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNRPAP09012 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNRPAP09012 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNRPAP09012 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNRPAP09012 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNRPAP09012 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNRPAP09012 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNRPAP09012 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNRPAP09012 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNRPAP09012 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNRPAP09012 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNRPAP09012 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNRPAP09012 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNRPAP09012 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNRPAP09012 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms