Protein–RNA interactions for Protein: P04844

RPN2, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN2P04844 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPN2P04844 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPN2P04844 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPN2P04844 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPN2P04844 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPN2P04844 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPN2P04844 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPN2P04844 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPN2P04844 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RPN2P04844 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPN2P04844 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPN2P04844 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPN2P04844 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPN2P04844 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPN2P04844 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPN2P04844 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPN2P04844 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPN2P04844 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RPN2P04844 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RPN2P04844 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPN2P04844 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPN2P04844 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPN2P04844 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPN2P04844 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RPN2P04844 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RPN2P04844 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPN2P04844 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPN2P04844 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPN2P04844 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPN2P04844 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPN2P04844 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPN2P04844 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPN2P04844 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPN2P04844 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPN2P04844 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPN2P04844 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPN2P04844 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPN2P04844 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPN2P04844 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RPN2P04844 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPN2P04844 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPN2P04844 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPN2P04844 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPN2P04844 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPN2P04844 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPN2P04844 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPN2P04844 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RPN2P04844 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RPN2P04844 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPN2P04844 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPN2P04844 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPN2P04844 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPN2P04844 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPN2P04844 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPN2P04844 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPN2P04844 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPN2P04844 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPN2P04844 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPN2P04844 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPN2P04844 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPN2P04844 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPN2P04844 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPN2P04844 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPN2P04844 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPN2P04844 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPN2P04844 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPN2P04844 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPN2P04844 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPN2P04844 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPN2P04844 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPN2P04844 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPN2P04844 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPN2P04844 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPN2P04844 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPN2P04844 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPN2P04844 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPN2P04844 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPN2P04844 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPN2P04844 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPN2P04844 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPN2P04844 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPN2P04844 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPN2P04844 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPN2P04844 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPN2P04844 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPN2P04844 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPN2P04844 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPN2P04844 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPN2P04844 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPN2P04844 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPN2P04844 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPN2P04844 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPN2P04844 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPN2P04844 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPN2P04844 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPN2P04844 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPN2P04844 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPN2P04844 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPN2P04844 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPN2P04844 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms