Protein–RNA interactions for Protein: P04433

IGKV3-11, Immunoglobulin kappa variable 3-11, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-11P04433 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGKV3-11P04433 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGKV3-11P04433 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGKV3-11P04433 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGKV3-11P04433 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGKV3-11P04433 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGKV3-11P04433 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGKV3-11P04433 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
IGKV3-11P04433 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGKV3-11P04433 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGKV3-11P04433 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGKV3-11P04433 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGKV3-11P04433 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGKV3-11P04433 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IGKV3-11P04433 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IGKV3-11P04433 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGKV3-11P04433 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGKV3-11P04433 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGKV3-11P04433 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGKV3-11P04433 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGKV3-11P04433 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGKV3-11P04433 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGKV3-11P04433 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGKV3-11P04433 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGKV3-11P04433 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGKV3-11P04433 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGKV3-11P04433 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGKV3-11P04433 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGKV3-11P04433 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IGKV3-11P04433 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IGKV3-11P04433 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGKV3-11P04433 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGKV3-11P04433 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGKV3-11P04433 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGKV3-11P04433 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGKV3-11P04433 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGKV3-11P04433 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGKV3-11P04433 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGKV3-11P04433 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGKV3-11P04433 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGKV3-11P04433 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGKV3-11P04433 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGKV3-11P04433 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGKV3-11P04433 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGKV3-11P04433 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGKV3-11P04433 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGKV3-11P04433 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGKV3-11P04433 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGKV3-11P04433 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGKV3-11P04433 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGKV3-11P04433 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGKV3-11P04433 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms