Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LCA5LO95447 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LCA5LO95447 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LCA5LO95447 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LCA5LO95447 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LCA5LO95447 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LCA5LO95447 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LCA5LO95447 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LCA5LO95447 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LCA5LO95447 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LCA5LO95447 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LCA5LO95447 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LCA5LO95447 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LCA5LO95447 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LCA5LO95447 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LCA5LO95447 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LCA5LO95447 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LCA5LO95447 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LCA5LO95447 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LCA5LO95447 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LCA5LO95447 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LCA5LO95447 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LCA5LO95447 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LCA5LO95447 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LCA5LO95447 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LCA5LO95447 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LCA5LO95447 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LCA5LO95447 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LCA5LO95447 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LCA5LO95447 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LCA5LO95447 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LCA5LO95447 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LCA5LO95447 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LCA5LO95447 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LCA5LO95447 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LCA5LO95447 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LCA5LO95447 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LCA5LO95447 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LCA5LO95447 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCA5LO95447 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCA5LO95447 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCA5LO95447 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCA5LO95447 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCA5LO95447 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LCA5LO95447 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LCA5LO95447 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LCA5LO95447 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LCA5LO95447 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LCA5LO95447 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LCA5LO95447 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LCA5LO95447 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LCA5LO95447 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LCA5LO95447 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LCA5LO95447 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms