Protein–RNA interactions for Protein: O75096

LRP4, Low-density lipoprotein receptor-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP4O75096 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP4O75096 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP4O75096 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP4O75096 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP4O75096 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP4O75096 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP4O75096 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP4O75096 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP4O75096 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP4O75096 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP4O75096 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP4O75096 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRP4O75096 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRP4O75096 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP4O75096 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP4O75096 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP4O75096 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP4O75096 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP4O75096 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP4O75096 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP4O75096 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP4O75096 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRP4O75096 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRP4O75096 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRP4O75096 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRP4O75096 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRP4O75096 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRP4O75096 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRP4O75096 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRP4O75096 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRP4O75096 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRP4O75096 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRP4O75096 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRP4O75096 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRP4O75096 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRP4O75096 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRP4O75096 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP4O75096 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP4O75096 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP4O75096 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP4O75096 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP4O75096 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP4O75096 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP4O75096 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP4O75096 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP4O75096 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP4O75096 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP4O75096 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP4O75096 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP4O75096 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP4O75096 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP4O75096 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP4O75096 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP4O75096 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP4O75096 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP4O75096 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP4O75096 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP4O75096 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP4O75096 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP4O75096 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP4O75096 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP4O75096 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP4O75096 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRP4O75096 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRP4O75096 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRP4O75096 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRP4O75096 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRP4O75096 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRP4O75096 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP4O75096 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP4O75096 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP4O75096 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP4O75096 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP4O75096 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP4O75096 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP4O75096 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP4O75096 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP4O75096 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP4O75096 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP4O75096 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP4O75096 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP4O75096 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP4O75096 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP4O75096 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP4O75096 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP4O75096 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP4O75096 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP4O75096 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP4O75096 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP4O75096 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP4O75096 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP4O75096 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP4O75096 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP4O75096 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP4O75096 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP4O75096 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP4O75096 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRP4O75096 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LRP4O75096 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LRP4O75096 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 728.5 ms