Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNSO60931 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNSO60931 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNSO60931 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNSO60931 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNSO60931 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNSO60931 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNSO60931 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNSO60931 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNSO60931 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNSO60931 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNSO60931 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNSO60931 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNSO60931 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNSO60931 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNSO60931 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNSO60931 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNSO60931 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNSO60931 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNSO60931 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNSO60931 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNSO60931 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNSO60931 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNSO60931 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNSO60931 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNSO60931 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNSO60931 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNSO60931 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNSO60931 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNSO60931 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNSO60931 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNSO60931 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNSO60931 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNSO60931 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNSO60931 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNSO60931 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNSO60931 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNSO60931 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNSO60931 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNSO60931 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNSO60931 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNSO60931 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTNSO60931 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTNSO60931 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNSO60931 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNSO60931 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNSO60931 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNSO60931 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNSO60931 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNSO60931 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNSO60931 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNSO60931 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNSO60931 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNSO60931 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNSO60931 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNSO60931 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNSO60931 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNSO60931 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNSO60931 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNSO60931 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNSO60931 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNSO60931 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNSO60931 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNSO60931 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNSO60931 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNSO60931 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNSO60931 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNSO60931 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNSO60931 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNSO60931 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNSO60931 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNSO60931 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNSO60931 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNSO60931 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNSO60931 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNSO60931 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNSO60931 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNSO60931 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNSO60931 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNSO60931 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNSO60931 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNSO60931 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNSO60931 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNSO60931 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNSO60931 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNSO60931 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNSO60931 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNSO60931 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNSO60931 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNSO60931 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNSO60931 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNSO60931 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNSO60931 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNSO60931 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNSO60931 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNSO60931 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNSO60931 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNSO60931 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNSO60931 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNSO60931 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.3 ms