Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP8B1O43520 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP8B1O43520 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP8B1O43520 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP8B1O43520 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP8B1O43520 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP8B1O43520 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP8B1O43520 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP8B1O43520 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP8B1O43520 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP8B1O43520 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP8B1O43520 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP8B1O43520 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP8B1O43520 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP8B1O43520 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP8B1O43520 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP8B1O43520 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP8B1O43520 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP8B1O43520 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP8B1O43520 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP8B1O43520 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP8B1O43520 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP8B1O43520 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP8B1O43520 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP8B1O43520 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP8B1O43520 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP8B1O43520 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP8B1O43520 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP8B1O43520 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP8B1O43520 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP8B1O43520 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP8B1O43520 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP8B1O43520 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP8B1O43520 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP8B1O43520 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP8B1O43520 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP8B1O43520 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP8B1O43520 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATP8B1O43520 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP8B1O43520 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP8B1O43520 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP8B1O43520 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP8B1O43520 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP8B1O43520 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP8B1O43520 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP8B1O43520 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP8B1O43520 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP8B1O43520 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP8B1O43520 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP8B1O43520 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP8B1O43520 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP8B1O43520 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP8B1O43520 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP8B1O43520 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP8B1O43520 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP8B1O43520 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP8B1O43520 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP8B1O43520 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP8B1O43520 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP8B1O43520 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP8B1O43520 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP8B1O43520 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP8B1O43520 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP8B1O43520 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP8B1O43520 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP8B1O43520 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP8B1O43520 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP8B1O43520 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP8B1O43520 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP8B1O43520 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP8B1O43520 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP8B1O43520 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP8B1O43520 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP8B1O43520 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP8B1O43520 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP8B1O43520 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP8B1O43520 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP8B1O43520 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP8B1O43520 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms