Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAP3K13O43283 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAP3K13O43283 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAP3K13O43283 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAP3K13O43283 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAP3K13O43283 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K13O43283 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K13O43283 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K13O43283 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K13O43283 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K13O43283 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K13O43283 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K13O43283 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K13O43283 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAP3K13O43283 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAP3K13O43283 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAP3K13O43283 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAP3K13O43283 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAP3K13O43283 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAP3K13O43283 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAP3K13O43283 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAP3K13O43283 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAP3K13O43283 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAP3K13O43283 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K13O43283 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K13O43283 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K13O43283 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K13O43283 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K13O43283 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K13O43283 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K13O43283 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K13O43283 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K13O43283 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K13O43283 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K13O43283 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K13O43283 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K13O43283 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K13O43283 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K13O43283 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAP3K13O43283 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAP3K13O43283 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAP3K13O43283 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAP3K13O43283 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAP3K13O43283 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAP3K13O43283 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAP3K13O43283 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAP3K13O43283 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAP3K13O43283 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAP3K13O43283 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAP3K13O43283 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAP3K13O43283 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K13O43283 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K13O43283 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K13O43283 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K13O43283 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K13O43283 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K13O43283 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K13O43283 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K13O43283 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K13O43283 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAP3K13O43283 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAP3K13O43283 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAP3K13O43283 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAP3K13O43283 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAP3K13O43283 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAP3K13O43283 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAP3K13O43283 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAP3K13O43283 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAP3K13O43283 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAP3K13O43283 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAP3K13O43283 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAP3K13O43283 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAP3K13O43283 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAP3K13O43283 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAP3K13O43283 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MAP3K13O43283 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAP3K13O43283 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAP3K13O43283 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAP3K13O43283 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAP3K13O43283 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAP3K13O43283 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MAP3K13O43283 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAP3K13O43283 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MAP3K13O43283 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MAP3K13O43283 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAP3K13O43283 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAP3K13O43283 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAP3K13O43283 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAP3K13O43283 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAP3K13O43283 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAP3K13O43283 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAP3K13O43283 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAP3K13O43283 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAP3K13O43283 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAP3K13O43283 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MAP3K13O43283 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAP3K13O43283 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAP3K13O43283 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAP3K13O43283 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAP3K13O43283 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms