Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
IFIT3O14879 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFIT3O14879 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFIT3O14879 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFIT3O14879 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFIT3O14879 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFIT3O14879 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFIT3O14879 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFIT3O14879 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFIT3O14879 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFIT3O14879 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFIT3O14879 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFIT3O14879 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFIT3O14879 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFIT3O14879 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFIT3O14879 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFIT3O14879 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFIT3O14879 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
IFIT3O14879 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFIT3O14879 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFIT3O14879 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFIT3O14879 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFIT3O14879 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFIT3O14879 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFIT3O14879 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFIT3O14879 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFIT3O14879 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFIT3O14879 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFIT3O14879 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFIT3O14879 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
IFIT3O14879 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
IFIT3O14879 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFIT3O14879 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFIT3O14879 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFIT3O14879 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFIT3O14879 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFIT3O14879 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFIT3O14879 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
IFIT3O14879 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFIT3O14879 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IFIT3O14879 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFIT3O14879 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFIT3O14879 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFIT3O14879 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
IFIT3O14879 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFIT3O14879 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFIT3O14879 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFIT3O14879 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFIT3O14879 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFIT3O14879 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFIT3O14879 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
IFIT3O14879 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFIT3O14879 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFIT3O14879 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFIT3O14879 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFIT3O14879 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFIT3O14879 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFIT3O14879 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFIT3O14879 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IFIT3O14879 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IFIT3O14879 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IFIT3O14879 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IFIT3O14879 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IFIT3O14879 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IFIT3O14879 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms