Protein–RNA interactions for Protein: O14493

CLDN4, Claudin-4, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN4O14493 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN4O14493 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN4O14493 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN4O14493 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN4O14493 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN4O14493 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN4O14493 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN4O14493 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN4O14493 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN4O14493 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN4O14493 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN4O14493 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN4O14493 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN4O14493 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN4O14493 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN4O14493 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN4O14493 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN4O14493 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN4O14493 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN4O14493 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN4O14493 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN4O14493 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN4O14493 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN4O14493 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN4O14493 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN4O14493 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN4O14493 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN4O14493 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN4O14493 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN4O14493 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN4O14493 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN4O14493 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN4O14493 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN4O14493 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN4O14493 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN4O14493 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN4O14493 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN4O14493 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN4O14493 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLDN4O14493 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN4O14493 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN4O14493 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN4O14493 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN4O14493 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN4O14493 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN4O14493 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN4O14493 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN4O14493 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN4O14493 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN4O14493 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN4O14493 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN4O14493 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN4O14493 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN4O14493 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN4O14493 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN4O14493 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN4O14493 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN4O14493 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN4O14493 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN4O14493 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN4O14493 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN4O14493 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN4O14493 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN4O14493 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN4O14493 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN4O14493 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN4O14493 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN4O14493 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN4O14493 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN4O14493 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN4O14493 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN4O14493 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN4O14493 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN4O14493 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN4O14493 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN4O14493 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN4O14493 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN4O14493 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN4O14493 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN4O14493 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDN4O14493 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN4O14493 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN4O14493 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN4O14493 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN4O14493 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN4O14493 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN4O14493 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN4O14493 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN4O14493 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN4O14493 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN4O14493 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN4O14493 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN4O14493 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN4O14493 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN4O14493 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN4O14493 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN4O14493 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN4O14493 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN4O14493 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN4O14493 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms