Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM38O00635 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM38O00635 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM38O00635 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM38O00635 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM38O00635 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM38O00635 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM38O00635 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM38O00635 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM38O00635 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM38O00635 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM38O00635 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM38O00635 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM38O00635 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM38O00635 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM38O00635 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM38O00635 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM38O00635 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM38O00635 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM38O00635 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM38O00635 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM38O00635 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM38O00635 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM38O00635 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM38O00635 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM38O00635 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM38O00635 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM38O00635 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM38O00635 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM38O00635 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM38O00635 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM38O00635 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM38O00635 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM38O00635 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms