Protein–RNA interactions for Protein: O00267

SUPT5H, Transcription elongation factor SPT5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT5HO00267 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
SUPT5HO00267 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC42.96■■■■■ 4.47
SUPT5HO00267 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
SUPT5HO00267 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
SUPT5HO00267 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
SUPT5HO00267 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
SUPT5HO00267 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
SUPT5HO00267 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC42.94■■■■■ 4.46
SUPT5HO00267 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
SUPT5HO00267 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC42.93■■■■■ 4.46
SUPT5HO00267 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
SUPT5HO00267 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC42.93■■■■■ 4.46
SUPT5HO00267 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
SUPT5HO00267 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
SUPT5HO00267 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
SUPT5HO00267 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
SUPT5HO00267 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC42.92■■■■■ 4.46
SUPT5HO00267 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
SUPT5HO00267 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
SUPT5HO00267 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
SUPT5HO00267 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC42.91■■■■■ 4.46
SUPT5HO00267 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC42.91■■■■■ 4.46
SUPT5HO00267 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
SUPT5HO00267 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
SUPT5HO00267 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
SUPT5HO00267 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC42.89■■■■■ 4.46
SUPT5HO00267 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC42.89■■■■■ 4.46
SUPT5HO00267 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC42.88■■■■■ 4.46
SUPT5HO00267 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
SUPT5HO00267 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC42.87■■■■■ 4.45
SUPT5HO00267 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
SUPT5HO00267 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.87■■■■■ 4.45
SUPT5HO00267 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
SUPT5HO00267 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC42.86■■■■■ 4.45
SUPT5HO00267 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
SUPT5HO00267 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC42.86■■■■■ 4.45
SUPT5HO00267 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC42.86■■■■■ 4.45
SUPT5HO00267 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
SUPT5HO00267 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
SUPT5HO00267 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
SUPT5HO00267 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
SUPT5HO00267 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.85■■■■■ 4.45
SUPT5HO00267 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC42.85■■■■■ 4.45
SUPT5HO00267 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC42.84■■■■■ 4.45
SUPT5HO00267 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.84■■■■■ 4.45
SUPT5HO00267 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
SUPT5HO00267 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
SUPT5HO00267 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC42.83■■■■■ 4.45
SUPT5HO00267 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
SUPT5HO00267 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC42.82■■■■■ 4.45
SUPT5HO00267 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
SUPT5HO00267 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.82■■■■■ 4.45
SUPT5HO00267 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.82■■■■■ 4.45
SUPT5HO00267 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.82■■■■■ 4.45
SUPT5HO00267 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
SUPT5HO00267 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.81■■■■■ 4.44
SUPT5HO00267 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
SUPT5HO00267 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
SUPT5HO00267 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC42.8■■■■■ 4.44
SUPT5HO00267 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC42.8■■■■■ 4.44
SUPT5HO00267 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC42.8■■■■■ 4.44
SUPT5HO00267 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
SUPT5HO00267 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
SUPT5HO00267 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
SUPT5HO00267 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
SUPT5HO00267 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC42.79■■■■■ 4.44
SUPT5HO00267 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC42.79■■■■■ 4.44
SUPT5HO00267 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC42.79■■■■■ 4.44
SUPT5HO00267 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC42.79■■■■■ 4.44
SUPT5HO00267 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
SUPT5HO00267 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
SUPT5HO00267 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.77■■■■■ 4.44
SUPT5HO00267 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC42.76■■■■■ 4.44
SUPT5HO00267 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC42.76■■■■■ 4.44
SUPT5HO00267 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
SUPT5HO00267 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC42.75■■■■■ 4.43
SUPT5HO00267 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC42.75■■■■■ 4.43
SUPT5HO00267 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC42.75■■■■■ 4.43
SUPT5HO00267 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC42.75■■■■■ 4.43
SUPT5HO00267 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC42.75■■■■■ 4.43
SUPT5HO00267 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC42.75■■■■■ 4.43
SUPT5HO00267 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
SUPT5HO00267 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
SUPT5HO00267 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
SUPT5HO00267 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
SUPT5HO00267 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
SUPT5HO00267 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
SUPT5HO00267 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
SUPT5HO00267 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC42.74■■■■■ 4.43
SUPT5HO00267 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC42.74■■■■■ 4.43
SUPT5HO00267 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
SUPT5HO00267 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
SUPT5HO00267 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
SUPT5HO00267 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
SUPT5HO00267 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC42.73■■■■■ 4.43
SUPT5HO00267 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
SUPT5HO00267 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC42.73■■■■■ 4.43
SUPT5HO00267 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
SUPT5HO00267 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
SUPT5HO00267 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms