Protein–RNA interactions for Protein: H7C350

CCDC188, Coiled-coil domain-containing protein 188, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC188H7C350 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC188H7C350 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC188H7C350 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC188H7C350 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC188H7C350 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC188H7C350 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC188H7C350 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC188H7C350 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC188H7C350 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC188H7C350 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC188H7C350 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC188H7C350 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC188H7C350 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC188H7C350 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC188H7C350 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC188H7C350 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC188H7C350 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC188H7C350 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC188H7C350 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC188H7C350 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC188H7C350 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC188H7C350 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC188H7C350 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC188H7C350 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC188H7C350 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC188H7C350 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC188H7C350 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC188H7C350 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC188H7C350 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC188H7C350 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC188H7C350 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC188H7C350 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC188H7C350 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC188H7C350 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC188H7C350 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC188H7C350 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC188H7C350 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms