Protein–RNA interactions for Protein: H7C1W4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1W4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
H7C1W4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
H7C1W4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
H7C1W4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
H7C1W4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
H7C1W4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
H7C1W4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
H7C1W4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
H7C1W4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
H7C1W4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
H7C1W4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30■■■□□ 2.39
H7C1W4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30■■■□□ 2.39
H7C1W4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
H7C1W4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
H7C1W4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
H7C1W4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
H7C1W4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
H7C1W4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
H7C1W4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
H7C1W4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
H7C1W4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
H7C1W4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
H7C1W4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
H7C1W4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
H7C1W4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
H7C1W4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
H7C1W4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
H7C1W4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
H7C1W4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
H7C1W4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
H7C1W4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
H7C1W4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
H7C1W4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
H7C1W4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
H7C1W4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
H7C1W4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
H7C1W4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
H7C1W4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
H7C1W4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
H7C1W4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
H7C1W4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
H7C1W4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
H7C1W4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
H7C1W4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
H7C1W4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
H7C1W4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
H7C1W4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
H7C1W4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
H7C1W4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
H7C1W4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
H7C1W4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
H7C1W4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
H7C1W4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
H7C1W4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
H7C1W4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
H7C1W4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
H7C1W4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
H7C1W4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
H7C1W4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
H7C1W4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
H7C1W4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
H7C1W4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
H7C1W4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
H7C1W4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
H7C1W4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
H7C1W4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
H7C1W4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
H7C1W4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
H7C1W4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
H7C1W4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
H7C1W4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
H7C1W4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
H7C1W4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
H7C1W4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
H7C1W4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
H7C1W4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
H7C1W4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
H7C1W4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
H7C1W4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
H7C1W4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
H7C1W4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
H7C1W4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
H7C1W4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
H7C1W4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
H7C1W4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
H7C1W4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
H7C1W4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
H7C1W4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
H7C1W4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
H7C1W4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
H7C1W4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
H7C1W4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
H7C1W4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
H7C1W4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
H7C1W4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
H7C1W4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
H7C1W4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
H7C1W4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
H7C1W4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
H7C1W4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms