Protein–RNA interactions for Protein: H3BQZ7

HNRNPUL2-BSCL2, HCG2044799, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC38.16■■■■□ 3.7
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC38.14■■■■□ 3.7
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC38.08■■■■□ 3.69
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC38.07■■■■□ 3.68
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC38.07■■■■□ 3.68
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC38■■■■□ 3.67
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC37.92■■■■□ 3.66
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms