Protein–RNA interactions for Protein: H3BNX3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNX3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BNX3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BNX3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BNX3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BNX3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BNX3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BNX3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H3BNX3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H3BNX3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
H3BNX3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H3BNX3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H3BNX3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H3BNX3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H3BNX3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BNX3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BNX3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BNX3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BNX3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BNX3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BNX3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BNX3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BNX3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BNX3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BNX3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BNX3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BNX3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BNX3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BNX3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BNX3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BNX3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BNX3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BNX3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BNX3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BNX3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BNX3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BNX3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BNX3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BNX3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BNX3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BNX3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BNX3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BNX3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BNX3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BNX3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BNX3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BNX3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BNX3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BNX3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BNX3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BNX3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BNX3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BNX3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BNX3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BNX3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BNX3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BNX3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BNX3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BNX3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BNX3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BNX3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BNX3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BNX3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BNX3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BNX3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BNX3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BNX3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BNX3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BNX3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BNX3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BNX3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BNX3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BNX3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BNX3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BNX3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BNX3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BNX3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BNX3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BNX3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BNX3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BNX3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BNX3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BNX3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BNX3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BNX3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BNX3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BNX3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BNX3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BNX3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BNX3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BNX3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BNX3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3BNX3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3BNX3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3BNX3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3BNX3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3BNX3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3BNX3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3BNX3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BNX3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BNX3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms