Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
E9PMD0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
E9PMD0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
E9PMD0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
E9PMD0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
E9PMD0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
E9PMD0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
E9PMD0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
E9PMD0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
E9PMD0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
E9PMD0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
E9PMD0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
E9PMD0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
E9PMD0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
E9PMD0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
E9PMD0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
E9PMD0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
E9PMD0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
E9PMD0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
E9PMD0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
E9PMD0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
E9PMD0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
E9PMD0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
E9PMD0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
E9PMD0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
E9PMD0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
E9PMD0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
E9PMD0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
E9PMD0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
E9PMD0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
E9PMD0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
E9PMD0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
E9PMD0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
E9PMD0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
E9PMD0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
E9PMD0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
E9PMD0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
E9PMD0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
E9PMD0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
E9PMD0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
E9PMD0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
E9PMD0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
E9PMD0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
E9PMD0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
E9PMD0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
E9PMD0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
E9PMD0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
E9PMD0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
E9PMD0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
E9PMD0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
E9PMD0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
E9PMD0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
E9PMD0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
E9PMD0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
E9PMD0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
E9PMD0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
E9PMD0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
E9PMD0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
E9PMD0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
E9PMD0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
E9PMD0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
E9PMD0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
E9PMD0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
E9PMD0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
E9PMD0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
E9PMD0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
E9PMD0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
E9PMD0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
E9PMD0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
E9PMD0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
E9PMD0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
E9PMD0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
E9PMD0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
E9PMD0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
E9PMD0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
E9PMD0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
E9PMD0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
E9PMD0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
E9PMD0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
E9PMD0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
E9PMD0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
E9PMD0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
E9PMD0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
E9PMD0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
E9PMD0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
E9PMD0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
E9PMD0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
E9PMD0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
E9PMD0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
E9PMD0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
E9PMD0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
E9PMD0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
E9PMD0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
E9PMD0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
E9PMD0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
E9PMD0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
E9PMD0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
E9PMD0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
E9PMD0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
E9PMD0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms