Protein–RNA interactions for Protein: A6NHJ4

ZNF860, Zinc finger protein 860, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF860A6NHJ4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF860A6NHJ4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF860A6NHJ4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF860A6NHJ4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF860A6NHJ4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF860A6NHJ4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF860A6NHJ4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF860A6NHJ4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF860A6NHJ4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF860A6NHJ4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF860A6NHJ4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF860A6NHJ4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF860A6NHJ4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF860A6NHJ4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF860A6NHJ4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF860A6NHJ4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF860A6NHJ4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF860A6NHJ4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF860A6NHJ4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF860A6NHJ4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF860A6NHJ4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF860A6NHJ4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF860A6NHJ4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF860A6NHJ4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF860A6NHJ4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF860A6NHJ4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF860A6NHJ4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF860A6NHJ4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF860A6NHJ4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF860A6NHJ4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF860A6NHJ4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF860A6NHJ4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF860A6NHJ4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF860A6NHJ4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF860A6NHJ4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF860A6NHJ4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF860A6NHJ4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF860A6NHJ4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF860A6NHJ4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF860A6NHJ4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF860A6NHJ4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF860A6NHJ4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF860A6NHJ4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF860A6NHJ4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF860A6NHJ4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF860A6NHJ4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF860A6NHJ4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF860A6NHJ4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms