Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP73A6NFT4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP73A6NFT4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP73A6NFT4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP73A6NFT4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP73A6NFT4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP73A6NFT4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP73A6NFT4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP73A6NFT4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP73A6NFT4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP73A6NFT4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP73A6NFT4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP73A6NFT4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP73A6NFT4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP73A6NFT4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP73A6NFT4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP73A6NFT4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP73A6NFT4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP73A6NFT4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP73A6NFT4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP73A6NFT4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP73A6NFT4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP73A6NFT4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP73A6NFT4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP73A6NFT4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP73A6NFT4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP73A6NFT4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP73A6NFT4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP73A6NFT4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP73A6NFT4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP73A6NFT4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP73A6NFT4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP73A6NFT4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP73A6NFT4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP73A6NFT4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP73A6NFT4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP73A6NFT4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP73A6NFT4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP73A6NFT4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP73A6NFT4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP73A6NFT4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP73A6NFT4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP73A6NFT4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP73A6NFT4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP73A6NFT4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP73A6NFT4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP73A6NFT4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP73A6NFT4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFAP73A6NFT4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFAP73A6NFT4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFAP73A6NFT4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFAP73A6NFT4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFAP73A6NFT4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 414.6 ms