Protein–RNA interactions for Protein: A0A5B9

TRBC2, T-cell receptor beta-2 chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC2A0A5B9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRBC2A0A5B9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRBC2A0A5B9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRBC2A0A5B9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRBC2A0A5B9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRBC2A0A5B9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRBC2A0A5B9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBC2A0A5B9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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