Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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