Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms