Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC1Q9Y5R8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms