Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P9

RABGAP1, Rab GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGAP1Q9Y3P9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RABGAP1Q9Y3P9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RABGAP1Q9Y3P9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RABGAP1Q9Y3P9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RABGAP1Q9Y3P9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RABGAP1Q9Y3P9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RABGAP1Q9Y3P9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RABGAP1Q9Y3P9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RABGAP1Q9Y3P9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RABGAP1Q9Y3P9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RABGAP1Q9Y3P9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RABGAP1Q9Y3P9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RABGAP1Q9Y3P9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RABGAP1Q9Y3P9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RABGAP1Q9Y3P9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RABGAP1Q9Y3P9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RABGAP1Q9Y3P9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RABGAP1Q9Y3P9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RABGAP1Q9Y3P9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RABGAP1Q9Y3P9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RABGAP1Q9Y3P9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RABGAP1Q9Y3P9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RABGAP1Q9Y3P9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RABGAP1Q9Y3P9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RABGAP1Q9Y3P9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RABGAP1Q9Y3P9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RABGAP1Q9Y3P9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RABGAP1Q9Y3P9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RABGAP1Q9Y3P9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RABGAP1Q9Y3P9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RABGAP1Q9Y3P9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RABGAP1Q9Y3P9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RABGAP1Q9Y3P9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RABGAP1Q9Y3P9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RABGAP1Q9Y3P9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RABGAP1Q9Y3P9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RABGAP1Q9Y3P9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RABGAP1Q9Y3P9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RABGAP1Q9Y3P9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RABGAP1Q9Y3P9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RABGAP1Q9Y3P9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RABGAP1Q9Y3P9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RABGAP1Q9Y3P9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RABGAP1Q9Y3P9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RABGAP1Q9Y3P9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RABGAP1Q9Y3P9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RABGAP1Q9Y3P9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RABGAP1Q9Y3P9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RABGAP1Q9Y3P9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RABGAP1Q9Y3P9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RABGAP1Q9Y3P9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RABGAP1Q9Y3P9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RABGAP1Q9Y3P9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RABGAP1Q9Y3P9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RABGAP1Q9Y3P9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RABGAP1Q9Y3P9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RABGAP1Q9Y3P9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RABGAP1Q9Y3P9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RABGAP1Q9Y3P9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RABGAP1Q9Y3P9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RABGAP1Q9Y3P9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RABGAP1Q9Y3P9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RABGAP1Q9Y3P9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RABGAP1Q9Y3P9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RABGAP1Q9Y3P9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RABGAP1Q9Y3P9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RABGAP1Q9Y3P9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RABGAP1Q9Y3P9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RABGAP1Q9Y3P9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RABGAP1Q9Y3P9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RABGAP1Q9Y3P9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RABGAP1Q9Y3P9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RABGAP1Q9Y3P9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RABGAP1Q9Y3P9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RABGAP1Q9Y3P9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RABGAP1Q9Y3P9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RABGAP1Q9Y3P9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RABGAP1Q9Y3P9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RABGAP1Q9Y3P9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RABGAP1Q9Y3P9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RABGAP1Q9Y3P9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RABGAP1Q9Y3P9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RABGAP1Q9Y3P9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RABGAP1Q9Y3P9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RABGAP1Q9Y3P9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RABGAP1Q9Y3P9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RABGAP1Q9Y3P9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RABGAP1Q9Y3P9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RABGAP1Q9Y3P9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RABGAP1Q9Y3P9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RABGAP1Q9Y3P9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RABGAP1Q9Y3P9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RABGAP1Q9Y3P9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RABGAP1Q9Y3P9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RABGAP1Q9Y3P9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RABGAP1Q9Y3P9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RABGAP1Q9Y3P9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RABGAP1Q9Y3P9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RABGAP1Q9Y3P9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RABGAP1Q9Y3P9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms