Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNL2

SSR3, Translocon-associated protein subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR3Q9UNL2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSR3Q9UNL2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSR3Q9UNL2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SSR3Q9UNL2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SSR3Q9UNL2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SSR3Q9UNL2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSR3Q9UNL2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSR3Q9UNL2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSR3Q9UNL2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSR3Q9UNL2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SSR3Q9UNL2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSR3Q9UNL2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSR3Q9UNL2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSR3Q9UNL2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSR3Q9UNL2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSR3Q9UNL2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSR3Q9UNL2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSR3Q9UNL2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSR3Q9UNL2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SSR3Q9UNL2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSR3Q9UNL2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSR3Q9UNL2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSR3Q9UNL2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSR3Q9UNL2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSR3Q9UNL2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSR3Q9UNL2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSR3Q9UNL2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSR3Q9UNL2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSR3Q9UNL2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSR3Q9UNL2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSR3Q9UNL2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSR3Q9UNL2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSR3Q9UNL2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSR3Q9UNL2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms