Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN74

PCDHA4, Protocadherin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA4Q9UN74 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHA4Q9UN74 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHA4Q9UN74 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHA4Q9UN74 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHA4Q9UN74 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHA4Q9UN74 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHA4Q9UN74 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHA4Q9UN74 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHA4Q9UN74 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHA4Q9UN74 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHA4Q9UN74 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHA4Q9UN74 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHA4Q9UN74 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHA4Q9UN74 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHA4Q9UN74 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHA4Q9UN74 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHA4Q9UN74 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHA4Q9UN74 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHA4Q9UN74 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHA4Q9UN74 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHA4Q9UN74 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHA4Q9UN74 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHA4Q9UN74 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHA4Q9UN74 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHA4Q9UN74 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHA4Q9UN74 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHA4Q9UN74 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PCDHA4Q9UN74 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PCDHA4Q9UN74 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHA4Q9UN74 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHA4Q9UN74 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHA4Q9UN74 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHA4Q9UN74 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHA4Q9UN74 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHA4Q9UN74 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHA4Q9UN74 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PCDHA4Q9UN74 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHA4Q9UN74 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
PCDHA4Q9UN74 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHA4Q9UN74 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHA4Q9UN74 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHA4Q9UN74 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHA4Q9UN74 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHA4Q9UN74 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHA4Q9UN74 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHA4Q9UN74 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHA4Q9UN74 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHA4Q9UN74 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHA4Q9UN74 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PCDHA4Q9UN74 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHA4Q9UN74 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHA4Q9UN74 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHA4Q9UN74 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHA4Q9UN74 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHA4Q9UN74 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHA4Q9UN74 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHA4Q9UN74 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHA4Q9UN74 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHA4Q9UN74 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHA4Q9UN74 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDHA4Q9UN74 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDHA4Q9UN74 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDHA4Q9UN74 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHA4Q9UN74 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHA4Q9UN74 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHA4Q9UN74 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHA4Q9UN74 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHA4Q9UN74 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHA4Q9UN74 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHA4Q9UN74 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDHA4Q9UN74 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDHA4Q9UN74 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDHA4Q9UN74 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDHA4Q9UN74 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDHA4Q9UN74 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDHA4Q9UN74 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDHA4Q9UN74 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDHA4Q9UN74 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDHA4Q9UN74 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDHA4Q9UN74 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PCDHA4Q9UN74 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PCDHA4Q9UN74 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCDHA4Q9UN74 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCDHA4Q9UN74 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCDHA4Q9UN74 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCDHA4Q9UN74 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCDHA4Q9UN74 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCDHA4Q9UN74 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PCDHA4Q9UN74 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCDHA4Q9UN74 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCDHA4Q9UN74 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCDHA4Q9UN74 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHA4Q9UN74 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHA4Q9UN74 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHA4Q9UN74 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHA4Q9UN74 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHA4Q9UN74 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHA4Q9UN74 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHA4Q9UN74 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHA4Q9UN74 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms