Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRPF3Q9ULD4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRPF3Q9ULD4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRPF3Q9ULD4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRPF3Q9ULD4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRPF3Q9ULD4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRPF3Q9ULD4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
BRPF3Q9ULD4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
BRPF3Q9ULD4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
BRPF3Q9ULD4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRPF3Q9ULD4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRPF3Q9ULD4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRPF3Q9ULD4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRPF3Q9ULD4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRPF3Q9ULD4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRPF3Q9ULD4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRPF3Q9ULD4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
BRPF3Q9ULD4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRPF3Q9ULD4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRPF3Q9ULD4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRPF3Q9ULD4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
BRPF3Q9ULD4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRPF3Q9ULD4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRPF3Q9ULD4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRPF3Q9ULD4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRPF3Q9ULD4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRPF3Q9ULD4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRPF3Q9ULD4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRPF3Q9ULD4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRPF3Q9ULD4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRPF3Q9ULD4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRPF3Q9ULD4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRPF3Q9ULD4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRPF3Q9ULD4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRPF3Q9ULD4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRPF3Q9ULD4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRPF3Q9ULD4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRPF3Q9ULD4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRPF3Q9ULD4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRPF3Q9ULD4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRPF3Q9ULD4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRPF3Q9ULD4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRPF3Q9ULD4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BRPF3Q9ULD4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BRPF3Q9ULD4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BRPF3Q9ULD4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BRPF3Q9ULD4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BRPF3Q9ULD4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
BRPF3Q9ULD4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
BRPF3Q9ULD4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRPF3Q9ULD4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRPF3Q9ULD4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRPF3Q9ULD4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRPF3Q9ULD4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRPF3Q9ULD4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRPF3Q9ULD4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRPF3Q9ULD4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
BRPF3Q9ULD4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BRPF3Q9ULD4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRPF3Q9ULD4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRPF3Q9ULD4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRPF3Q9ULD4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRPF3Q9ULD4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRPF3Q9ULD4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
BRPF3Q9ULD4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRPF3Q9ULD4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRPF3Q9ULD4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRPF3Q9ULD4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRPF3Q9ULD4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
BRPF3Q9ULD4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRPF3Q9ULD4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
BRPF3Q9ULD4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRPF3Q9ULD4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRPF3Q9ULD4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRPF3Q9ULD4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRPF3Q9ULD4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRPF3Q9ULD4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRPF3Q9ULD4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRPF3Q9ULD4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRPF3Q9ULD4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRPF3Q9ULD4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRPF3Q9ULD4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRPF3Q9ULD4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
BRPF3Q9ULD4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRPF3Q9ULD4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRPF3Q9ULD4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
BRPF3Q9ULD4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRPF3Q9ULD4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRPF3Q9ULD4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRPF3Q9ULD4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRPF3Q9ULD4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BRPF3Q9ULD4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BRPF3Q9ULD4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BRPF3Q9ULD4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
BRPF3Q9ULD4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BRPF3Q9ULD4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BRPF3Q9ULD4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BRPF3Q9ULD4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BRPF3Q9ULD4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BRPF3Q9ULD4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms