Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SS18L2Q9UHA2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SS18L2Q9UHA2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms