Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ0

DNAJC27, DnaJ homolog subfamily C member 27, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC27Q9NZQ0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJC27Q9NZQ0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJC27Q9NZQ0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJC27Q9NZQ0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJC27Q9NZQ0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJC27Q9NZQ0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJC27Q9NZQ0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJC27Q9NZQ0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJC27Q9NZQ0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJC27Q9NZQ0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJC27Q9NZQ0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJC27Q9NZQ0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJC27Q9NZQ0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJC27Q9NZQ0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJC27Q9NZQ0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJC27Q9NZQ0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJC27Q9NZQ0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJC27Q9NZQ0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJC27Q9NZQ0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJC27Q9NZQ0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DNAJC27Q9NZQ0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJC27Q9NZQ0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms