Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV7

PRDM9, Histone-lysine N-methyltransferase PRDM9, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM9Q9NQV7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM9Q9NQV7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM9Q9NQV7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM9Q9NQV7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM9Q9NQV7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM9Q9NQV7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM9Q9NQV7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM9Q9NQV7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM9Q9NQV7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM9Q9NQV7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM9Q9NQV7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM9Q9NQV7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM9Q9NQV7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM9Q9NQV7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM9Q9NQV7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM9Q9NQV7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM9Q9NQV7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM9Q9NQV7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM9Q9NQV7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM9Q9NQV7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM9Q9NQV7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM9Q9NQV7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM9Q9NQV7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM9Q9NQV7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM9Q9NQV7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM9Q9NQV7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM9Q9NQV7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM9Q9NQV7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM9Q9NQV7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM9Q9NQV7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM9Q9NQV7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM9Q9NQV7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM9Q9NQV7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM9Q9NQV7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM9Q9NQV7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM9Q9NQV7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM9Q9NQV7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM9Q9NQV7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM9Q9NQV7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM9Q9NQV7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM9Q9NQV7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM9Q9NQV7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM9Q9NQV7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM9Q9NQV7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM9Q9NQV7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM9Q9NQV7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM9Q9NQV7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM9Q9NQV7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM9Q9NQV7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM9Q9NQV7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM9Q9NQV7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM9Q9NQV7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM9Q9NQV7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM9Q9NQV7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM9Q9NQV7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM9Q9NQV7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM9Q9NQV7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM9Q9NQV7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM9Q9NQV7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM9Q9NQV7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM9Q9NQV7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM9Q9NQV7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM9Q9NQV7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM9Q9NQV7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM9Q9NQV7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM9Q9NQV7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM9Q9NQV7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM9Q9NQV7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM9Q9NQV7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM9Q9NQV7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM9Q9NQV7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM9Q9NQV7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRDM9Q9NQV7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM9Q9NQV7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM9Q9NQV7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM9Q9NQV7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM9Q9NQV7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM9Q9NQV7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM9Q9NQV7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM9Q9NQV7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM9Q9NQV7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM9Q9NQV7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM9Q9NQV7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM9Q9NQV7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM9Q9NQV7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM9Q9NQV7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM9Q9NQV7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM9Q9NQV7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM9Q9NQV7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM9Q9NQV7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM9Q9NQV7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM9Q9NQV7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM9Q9NQV7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM9Q9NQV7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM9Q9NQV7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM9Q9NQV7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM9Q9NQV7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM9Q9NQV7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM9Q9NQV7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM9Q9NQV7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms