Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR7

CCDC177, Coiled-coil domain-containing protein 177, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC177Q9NQR7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC177Q9NQR7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC177Q9NQR7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC177Q9NQR7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC177Q9NQR7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC177Q9NQR7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC177Q9NQR7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC177Q9NQR7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC177Q9NQR7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC177Q9NQR7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC177Q9NQR7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC177Q9NQR7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC177Q9NQR7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC177Q9NQR7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC177Q9NQR7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC177Q9NQR7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC177Q9NQR7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC177Q9NQR7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC177Q9NQR7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC177Q9NQR7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC177Q9NQR7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC177Q9NQR7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC177Q9NQR7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC177Q9NQR7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC177Q9NQR7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC177Q9NQR7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC177Q9NQR7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC177Q9NQR7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC177Q9NQR7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC177Q9NQR7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC177Q9NQR7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC177Q9NQR7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC177Q9NQR7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC177Q9NQR7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC177Q9NQR7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC177Q9NQR7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC177Q9NQR7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC177Q9NQR7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC177Q9NQR7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC177Q9NQR7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC177Q9NQR7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC177Q9NQR7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC177Q9NQR7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC177Q9NQR7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC177Q9NQR7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC177Q9NQR7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC177Q9NQR7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC177Q9NQR7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC177Q9NQR7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC177Q9NQR7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC177Q9NQR7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC177Q9NQR7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC177Q9NQR7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC177Q9NQR7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC177Q9NQR7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC177Q9NQR7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC177Q9NQR7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC177Q9NQR7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC177Q9NQR7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC177Q9NQR7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC177Q9NQR7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC177Q9NQR7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC177Q9NQR7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC177Q9NQR7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC177Q9NQR7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC177Q9NQR7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC177Q9NQR7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC177Q9NQR7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC177Q9NQR7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC177Q9NQR7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC177Q9NQR7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC177Q9NQR7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC177Q9NQR7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC177Q9NQR7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC177Q9NQR7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC177Q9NQR7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC177Q9NQR7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC177Q9NQR7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC177Q9NQR7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC177Q9NQR7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC177Q9NQR7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC177Q9NQR7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC177Q9NQR7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC177Q9NQR7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC177Q9NQR7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC177Q9NQR7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC177Q9NQR7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC177Q9NQR7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC177Q9NQR7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC177Q9NQR7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC177Q9NQR7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC177Q9NQR7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC177Q9NQR7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC177Q9NQR7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC177Q9NQR7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC177Q9NQR7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC177Q9NQR7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC177Q9NQR7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC177Q9NQR7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC177Q9NQR7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms