Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR2

REXO4, RNA exonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4Q9GZR2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
REXO4Q9GZR2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
REXO4Q9GZR2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
REXO4Q9GZR2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
REXO4Q9GZR2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
REXO4Q9GZR2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
REXO4Q9GZR2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
REXO4Q9GZR2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
REXO4Q9GZR2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
REXO4Q9GZR2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
REXO4Q9GZR2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
REXO4Q9GZR2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
REXO4Q9GZR2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
REXO4Q9GZR2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
REXO4Q9GZR2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
REXO4Q9GZR2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
REXO4Q9GZR2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
REXO4Q9GZR2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
REXO4Q9GZR2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
REXO4Q9GZR2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
REXO4Q9GZR2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
REXO4Q9GZR2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REXO4Q9GZR2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REXO4Q9GZR2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REXO4Q9GZR2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REXO4Q9GZR2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REXO4Q9GZR2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
REXO4Q9GZR2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
REXO4Q9GZR2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
REXO4Q9GZR2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REXO4Q9GZR2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
REXO4Q9GZR2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
REXO4Q9GZR2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
REXO4Q9GZR2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
REXO4Q9GZR2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
REXO4Q9GZR2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REXO4Q9GZR2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
REXO4Q9GZR2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REXO4Q9GZR2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
REXO4Q9GZR2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
REXO4Q9GZR2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
REXO4Q9GZR2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
REXO4Q9GZR2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
REXO4Q9GZR2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
REXO4Q9GZR2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
REXO4Q9GZR2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
REXO4Q9GZR2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
REXO4Q9GZR2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
REXO4Q9GZR2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
REXO4Q9GZR2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
REXO4Q9GZR2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
REXO4Q9GZR2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
REXO4Q9GZR2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
REXO4Q9GZR2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
REXO4Q9GZR2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
REXO4Q9GZR2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms