Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC2Q9BYS8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC2Q9BYS8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC2Q9BYS8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC2Q9BYS8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC2Q9BYS8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC2Q9BYS8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC2Q9BYS8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC2Q9BYS8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC2Q9BYS8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC2Q9BYS8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC2Q9BYS8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC2Q9BYS8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC2Q9BYS8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC2Q9BYS8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC2Q9BYS8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC2Q9BYS8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC2Q9BYS8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC2Q9BYS8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC2Q9BYS8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC2Q9BYS8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC2Q9BYS8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC2Q9BYS8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC2Q9BYS8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC2Q9BYS8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
LRRC2Q9BYS8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC2Q9BYS8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC2Q9BYS8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC2Q9BYS8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC2Q9BYS8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC2Q9BYS8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC2Q9BYS8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC2Q9BYS8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC2Q9BYS8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC2Q9BYS8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC2Q9BYS8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC2Q9BYS8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC2Q9BYS8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC2Q9BYS8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC2Q9BYS8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC2Q9BYS8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC2Q9BYS8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC2Q9BYS8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC2Q9BYS8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC2Q9BYS8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC2Q9BYS8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC2Q9BYS8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC2Q9BYS8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC2Q9BYS8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC2Q9BYS8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC2Q9BYS8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC2Q9BYS8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC2Q9BYS8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC2Q9BYS8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC2Q9BYS8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC2Q9BYS8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC2Q9BYS8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC2Q9BYS8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC2Q9BYS8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC2Q9BYS8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC2Q9BYS8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC2Q9BYS8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC2Q9BYS8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC2Q9BYS8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC2Q9BYS8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC2Q9BYS8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC2Q9BYS8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC2Q9BYS8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC2Q9BYS8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC2Q9BYS8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC2Q9BYS8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC2Q9BYS8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC2Q9BYS8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC2Q9BYS8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC2Q9BYS8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC2Q9BYS8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC2Q9BYS8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC2Q9BYS8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC2Q9BYS8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC2Q9BYS8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC2Q9BYS8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC2Q9BYS8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC2Q9BYS8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC2Q9BYS8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC2Q9BYS8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC2Q9BYS8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC2Q9BYS8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC2Q9BYS8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC2Q9BYS8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC2Q9BYS8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC2Q9BYS8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC2Q9BYS8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC2Q9BYS8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC2Q9BYS8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC2Q9BYS8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC2Q9BYS8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC2Q9BYS8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC2Q9BYS8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC2Q9BYS8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC2Q9BYS8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms