Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY65

NPCDR1, Nasopharyngeal carcinoma down-regulated gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPCDR1Q9BY65 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NPCDR1Q9BY65 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPCDR1Q9BY65 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NPCDR1Q9BY65 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NPCDR1Q9BY65 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NPCDR1Q9BY65 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NPCDR1Q9BY65 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NPCDR1Q9BY65 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NPCDR1Q9BY65 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NPCDR1Q9BY65 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NPCDR1Q9BY65 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NPCDR1Q9BY65 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NPCDR1Q9BY65 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NPCDR1Q9BY65 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NPCDR1Q9BY65 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NPCDR1Q9BY65 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NPCDR1Q9BY65 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NPCDR1Q9BY65 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NPCDR1Q9BY65 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NPCDR1Q9BY65 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NPCDR1Q9BY65 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NPCDR1Q9BY65 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NPCDR1Q9BY65 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NPCDR1Q9BY65 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NPCDR1Q9BY65 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPCDR1Q9BY65 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPCDR1Q9BY65 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPCDR1Q9BY65 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NPCDR1Q9BY65 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPCDR1Q9BY65 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPCDR1Q9BY65 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPCDR1Q9BY65 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPCDR1Q9BY65 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPCDR1Q9BY65 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPCDR1Q9BY65 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPCDR1Q9BY65 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPCDR1Q9BY65 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPCDR1Q9BY65 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NPCDR1Q9BY65 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NPCDR1Q9BY65 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NPCDR1Q9BY65 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NPCDR1Q9BY65 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms