Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL25A1Q9BXS0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
COL25A1Q9BXS0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL25A1Q9BXS0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL25A1Q9BXS0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL25A1Q9BXS0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL25A1Q9BXS0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL25A1Q9BXS0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL25A1Q9BXS0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL25A1Q9BXS0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL25A1Q9BXS0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL25A1Q9BXS0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
COL25A1Q9BXS0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL25A1Q9BXS0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL25A1Q9BXS0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL25A1Q9BXS0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL25A1Q9BXS0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
COL25A1Q9BXS0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL25A1Q9BXS0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL25A1Q9BXS0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL25A1Q9BXS0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COL25A1Q9BXS0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL25A1Q9BXS0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL25A1Q9BXS0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL25A1Q9BXS0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
COL25A1Q9BXS0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL25A1Q9BXS0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL25A1Q9BXS0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL25A1Q9BXS0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL25A1Q9BXS0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL25A1Q9BXS0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL25A1Q9BXS0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL25A1Q9BXS0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL25A1Q9BXS0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL25A1Q9BXS0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL25A1Q9BXS0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL25A1Q9BXS0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
COL25A1Q9BXS0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL25A1Q9BXS0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL25A1Q9BXS0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL25A1Q9BXS0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL25A1Q9BXS0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL25A1Q9BXS0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL25A1Q9BXS0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL25A1Q9BXS0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL25A1Q9BXS0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL25A1Q9BXS0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL25A1Q9BXS0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL25A1Q9BXS0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
COL25A1Q9BXS0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL25A1Q9BXS0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL25A1Q9BXS0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL25A1Q9BXS0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL25A1Q9BXS0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
COL25A1Q9BXS0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL25A1Q9BXS0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL25A1Q9BXS0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL25A1Q9BXS0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL25A1Q9BXS0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
COL25A1Q9BXS0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL25A1Q9BXS0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL25A1Q9BXS0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL25A1Q9BXS0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL25A1Q9BXS0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL25A1Q9BXS0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL25A1Q9BXS0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
COL25A1Q9BXS0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL25A1Q9BXS0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL25A1Q9BXS0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL25A1Q9BXS0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL25A1Q9BXS0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL25A1Q9BXS0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL25A1Q9BXS0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL25A1Q9BXS0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL25A1Q9BXS0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
COL25A1Q9BXS0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL25A1Q9BXS0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL25A1Q9BXS0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
COL25A1Q9BXS0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL25A1Q9BXS0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL25A1Q9BXS0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
COL25A1Q9BXS0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL25A1Q9BXS0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL25A1Q9BXS0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL25A1Q9BXS0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL25A1Q9BXS0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL25A1Q9BXS0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL25A1Q9BXS0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL25A1Q9BXS0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
COL25A1Q9BXS0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL25A1Q9BXS0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL25A1Q9BXS0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL25A1Q9BXS0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL25A1Q9BXS0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL25A1Q9BXS0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL25A1Q9BXS0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL25A1Q9BXS0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL25A1Q9BXS0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL25A1Q9BXS0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL25A1Q9BXS0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms