Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUFY1Q96T51 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUFY1Q96T51 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUFY1Q96T51 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RUFY1Q96T51 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUFY1Q96T51 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUFY1Q96T51 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUFY1Q96T51 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUFY1Q96T51 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUFY1Q96T51 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RUFY1Q96T51 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUFY1Q96T51 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUFY1Q96T51 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUFY1Q96T51 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUFY1Q96T51 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUFY1Q96T51 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUFY1Q96T51 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUFY1Q96T51 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUFY1Q96T51 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUFY1Q96T51 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUFY1Q96T51 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUFY1Q96T51 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUFY1Q96T51 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUFY1Q96T51 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUFY1Q96T51 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUFY1Q96T51 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUFY1Q96T51 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUFY1Q96T51 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUFY1Q96T51 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUFY1Q96T51 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUFY1Q96T51 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUFY1Q96T51 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUFY1Q96T51 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUFY1Q96T51 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RUFY1Q96T51 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RUFY1Q96T51 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUFY1Q96T51 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUFY1Q96T51 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUFY1Q96T51 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUFY1Q96T51 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUFY1Q96T51 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUFY1Q96T51 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUFY1Q96T51 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUFY1Q96T51 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUFY1Q96T51 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUFY1Q96T51 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY1Q96T51 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY1Q96T51 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY1Q96T51 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY1Q96T51 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY1Q96T51 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY1Q96T51 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY1Q96T51 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY1Q96T51 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY1Q96T51 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY1Q96T51 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY1Q96T51 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY1Q96T51 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY1Q96T51 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY1Q96T51 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY1Q96T51 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY1Q96T51 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY1Q96T51 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY1Q96T51 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY1Q96T51 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY1Q96T51 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY1Q96T51 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY1Q96T51 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY1Q96T51 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY1Q96T51 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUFY1Q96T51 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUFY1Q96T51 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUFY1Q96T51 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUFY1Q96T51 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RUFY1Q96T51 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms