Protein–RNA interactions for Protein: Q96S94

CCNL2, Cyclin-L2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL2Q96S94 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNL2Q96S94 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNL2Q96S94 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNL2Q96S94 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNL2Q96S94 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNL2Q96S94 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNL2Q96S94 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNL2Q96S94 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNL2Q96S94 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNL2Q96S94 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNL2Q96S94 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCNL2Q96S94 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCNL2Q96S94 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNL2Q96S94 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNL2Q96S94 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNL2Q96S94 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNL2Q96S94 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNL2Q96S94 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNL2Q96S94 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNL2Q96S94 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNL2Q96S94 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNL2Q96S94 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNL2Q96S94 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNL2Q96S94 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNL2Q96S94 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNL2Q96S94 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNL2Q96S94 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNL2Q96S94 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNL2Q96S94 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNL2Q96S94 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNL2Q96S94 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNL2Q96S94 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNL2Q96S94 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNL2Q96S94 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNL2Q96S94 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNL2Q96S94 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNL2Q96S94 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNL2Q96S94 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNL2Q96S94 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNL2Q96S94 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNL2Q96S94 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNL2Q96S94 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNL2Q96S94 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNL2Q96S94 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNL2Q96S94 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNL2Q96S94 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNL2Q96S94 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNL2Q96S94 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNL2Q96S94 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCNL2Q96S94 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms