Protein–RNA interactions for Protein: Q96S86

HAPLN3, Hyaluronan and proteoglycan link protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN3Q96S86 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HAPLN3Q96S86 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HAPLN3Q96S86 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HAPLN3Q96S86 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HAPLN3Q96S86 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HAPLN3Q96S86 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HAPLN3Q96S86 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HAPLN3Q96S86 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HAPLN3Q96S86 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HAPLN3Q96S86 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HAPLN3Q96S86 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HAPLN3Q96S86 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HAPLN3Q96S86 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HAPLN3Q96S86 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HAPLN3Q96S86 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HAPLN3Q96S86 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HAPLN3Q96S86 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HAPLN3Q96S86 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HAPLN3Q96S86 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HAPLN3Q96S86 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HAPLN3Q96S86 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HAPLN3Q96S86 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HAPLN3Q96S86 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HAPLN3Q96S86 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HAPLN3Q96S86 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HAPLN3Q96S86 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HAPLN3Q96S86 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HAPLN3Q96S86 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HAPLN3Q96S86 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HAPLN3Q96S86 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HAPLN3Q96S86 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HAPLN3Q96S86 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HAPLN3Q96S86 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HAPLN3Q96S86 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HAPLN3Q96S86 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HAPLN3Q96S86 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HAPLN3Q96S86 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HAPLN3Q96S86 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HAPLN3Q96S86 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HAPLN3Q96S86 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HAPLN3Q96S86 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HAPLN3Q96S86 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HAPLN3Q96S86 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HAPLN3Q96S86 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HAPLN3Q96S86 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HAPLN3Q96S86 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HAPLN3Q96S86 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HAPLN3Q96S86 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HAPLN3Q96S86 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HAPLN3Q96S86 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HAPLN3Q96S86 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HAPLN3Q96S86 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HAPLN3Q96S86 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HAPLN3Q96S86 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HAPLN3Q96S86 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HAPLN3Q96S86 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HAPLN3Q96S86 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HAPLN3Q96S86 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HAPLN3Q96S86 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HAPLN3Q96S86 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HAPLN3Q96S86 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HAPLN3Q96S86 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HAPLN3Q96S86 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HAPLN3Q96S86 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HAPLN3Q96S86 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HAPLN3Q96S86 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HAPLN3Q96S86 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HAPLN3Q96S86 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HAPLN3Q96S86 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HAPLN3Q96S86 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HAPLN3Q96S86 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HAPLN3Q96S86 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HAPLN3Q96S86 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HAPLN3Q96S86 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HAPLN3Q96S86 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HAPLN3Q96S86 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HAPLN3Q96S86 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HAPLN3Q96S86 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HAPLN3Q96S86 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HAPLN3Q96S86 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HAPLN3Q96S86 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HAPLN3Q96S86 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HAPLN3Q96S86 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HAPLN3Q96S86 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HAPLN3Q96S86 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HAPLN3Q96S86 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HAPLN3Q96S86 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HAPLN3Q96S86 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HAPLN3Q96S86 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HAPLN3Q96S86 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HAPLN3Q96S86 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HAPLN3Q96S86 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HAPLN3Q96S86 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HAPLN3Q96S86 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HAPLN3Q96S86 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HAPLN3Q96S86 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HAPLN3Q96S86 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HAPLN3Q96S86 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HAPLN3Q96S86 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HAPLN3Q96S86 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms