Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF12Q96QT6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PHF12Q96QT6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF12Q96QT6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF12Q96QT6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF12Q96QT6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF12Q96QT6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms