Protein–RNA interactions for Protein: Q96QE5

TEFM, Transcription elongation factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFMQ96QE5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TEFMQ96QE5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TEFMQ96QE5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TEFMQ96QE5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TEFMQ96QE5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TEFMQ96QE5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TEFMQ96QE5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TEFMQ96QE5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TEFMQ96QE5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TEFMQ96QE5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TEFMQ96QE5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TEFMQ96QE5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TEFMQ96QE5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TEFMQ96QE5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TEFMQ96QE5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TEFMQ96QE5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TEFMQ96QE5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TEFMQ96QE5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TEFMQ96QE5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TEFMQ96QE5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TEFMQ96QE5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TEFMQ96QE5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TEFMQ96QE5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TEFMQ96QE5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TEFMQ96QE5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TEFMQ96QE5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TEFMQ96QE5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TEFMQ96QE5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TEFMQ96QE5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TEFMQ96QE5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TEFMQ96QE5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TEFMQ96QE5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TEFMQ96QE5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TEFMQ96QE5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TEFMQ96QE5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TEFMQ96QE5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TEFMQ96QE5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TEFMQ96QE5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms