Protein–RNA interactions for Protein: Q96HF1

SFRP2, Secreted frizzled-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP2Q96HF1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SFRP2Q96HF1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFRP2Q96HF1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFRP2Q96HF1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms