Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00526Q96FQ7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00526Q96FQ7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00526Q96FQ7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms