Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGF29Q96ES7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGF29Q96ES7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGF29Q96ES7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGF29Q96ES7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGF29Q96ES7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGF29Q96ES7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGF29Q96ES7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGF29Q96ES7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGF29Q96ES7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGF29Q96ES7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGF29Q96ES7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGF29Q96ES7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGF29Q96ES7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGF29Q96ES7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGF29Q96ES7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGF29Q96ES7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGF29Q96ES7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGF29Q96ES7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SGF29Q96ES7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SGF29Q96ES7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGF29Q96ES7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGF29Q96ES7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGF29Q96ES7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGF29Q96ES7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGF29Q96ES7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGF29Q96ES7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGF29Q96ES7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGF29Q96ES7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGF29Q96ES7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGF29Q96ES7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGF29Q96ES7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGF29Q96ES7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SGF29Q96ES7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGF29Q96ES7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGF29Q96ES7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGF29Q96ES7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SGF29Q96ES7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGF29Q96ES7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGF29Q96ES7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGF29Q96ES7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGF29Q96ES7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGF29Q96ES7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGF29Q96ES7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGF29Q96ES7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGF29Q96ES7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGF29Q96ES7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGF29Q96ES7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGF29Q96ES7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SGF29Q96ES7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGF29Q96ES7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGF29Q96ES7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGF29Q96ES7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGF29Q96ES7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGF29Q96ES7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGF29Q96ES7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGF29Q96ES7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGF29Q96ES7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SGF29Q96ES7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGF29Q96ES7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGF29Q96ES7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGF29Q96ES7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGF29Q96ES7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGF29Q96ES7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGF29Q96ES7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGF29Q96ES7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGF29Q96ES7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGF29Q96ES7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGF29Q96ES7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGF29Q96ES7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGF29Q96ES7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGF29Q96ES7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGF29Q96ES7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGF29Q96ES7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGF29Q96ES7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SGF29Q96ES7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGF29Q96ES7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGF29Q96ES7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGF29Q96ES7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGF29Q96ES7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGF29Q96ES7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SGF29Q96ES7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SGF29Q96ES7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SGF29Q96ES7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGF29Q96ES7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SGF29Q96ES7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGF29Q96ES7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGF29Q96ES7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SGF29Q96ES7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGF29Q96ES7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGF29Q96ES7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGF29Q96ES7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGF29Q96ES7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGF29Q96ES7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SGF29Q96ES7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGF29Q96ES7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGF29Q96ES7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SGF29Q96ES7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGF29Q96ES7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SGF29Q96ES7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms