Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC7

TMCO6, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO6Q96DC7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO6Q96DC7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO6Q96DC7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO6Q96DC7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO6Q96DC7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO6Q96DC7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO6Q96DC7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO6Q96DC7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO6Q96DC7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO6Q96DC7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO6Q96DC7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO6Q96DC7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO6Q96DC7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO6Q96DC7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO6Q96DC7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO6Q96DC7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO6Q96DC7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO6Q96DC7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO6Q96DC7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO6Q96DC7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO6Q96DC7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO6Q96DC7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO6Q96DC7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO6Q96DC7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO6Q96DC7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO6Q96DC7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO6Q96DC7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO6Q96DC7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO6Q96DC7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO6Q96DC7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO6Q96DC7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO6Q96DC7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO6Q96DC7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO6Q96DC7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMCO6Q96DC7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMCO6Q96DC7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMCO6Q96DC7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMCO6Q96DC7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO6Q96DC7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO6Q96DC7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO6Q96DC7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO6Q96DC7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO6Q96DC7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO6Q96DC7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO6Q96DC7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO6Q96DC7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO6Q96DC7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO6Q96DC7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO6Q96DC7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO6Q96DC7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO6Q96DC7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO6Q96DC7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO6Q96DC7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO6Q96DC7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO6Q96DC7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO6Q96DC7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO6Q96DC7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO6Q96DC7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO6Q96DC7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO6Q96DC7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO6Q96DC7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO6Q96DC7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO6Q96DC7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO6Q96DC7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO6Q96DC7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO6Q96DC7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO6Q96DC7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO6Q96DC7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO6Q96DC7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO6Q96DC7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO6Q96DC7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO6Q96DC7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO6Q96DC7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO6Q96DC7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO6Q96DC7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO6Q96DC7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO6Q96DC7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO6Q96DC7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO6Q96DC7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO6Q96DC7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO6Q96DC7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms