Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NMD3Q96D46 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NMD3Q96D46 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NMD3Q96D46 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NMD3Q96D46 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NMD3Q96D46 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NMD3Q96D46 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NMD3Q96D46 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NMD3Q96D46 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NMD3Q96D46 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NMD3Q96D46 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NMD3Q96D46 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NMD3Q96D46 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NMD3Q96D46 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NMD3Q96D46 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NMD3Q96D46 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.6 ms