Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
VTI1AQ96AJ9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VTI1AQ96AJ9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VTI1AQ96AJ9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VTI1AQ96AJ9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VTI1AQ96AJ9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VTI1AQ96AJ9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VTI1AQ96AJ9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VTI1AQ96AJ9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VTI1AQ96AJ9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VTI1AQ96AJ9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VTI1AQ96AJ9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VTI1AQ96AJ9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VTI1AQ96AJ9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VTI1AQ96AJ9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VTI1AQ96AJ9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VTI1AQ96AJ9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
VTI1AQ96AJ9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VTI1AQ96AJ9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VTI1AQ96AJ9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
VTI1AQ96AJ9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
VTI1AQ96AJ9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VTI1AQ96AJ9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
VTI1AQ96AJ9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
VTI1AQ96AJ9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VTI1AQ96AJ9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VTI1AQ96AJ9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VTI1AQ96AJ9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VTI1AQ96AJ9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VTI1AQ96AJ9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
VTI1AQ96AJ9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VTI1AQ96AJ9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VTI1AQ96AJ9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VTI1AQ96AJ9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VTI1AQ96AJ9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VTI1AQ96AJ9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VTI1AQ96AJ9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VTI1AQ96AJ9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VTI1AQ96AJ9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VTI1AQ96AJ9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VTI1AQ96AJ9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VTI1AQ96AJ9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VTI1AQ96AJ9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VTI1AQ96AJ9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
VTI1AQ96AJ9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VTI1AQ96AJ9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VTI1AQ96AJ9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VTI1AQ96AJ9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VTI1AQ96AJ9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VTI1AQ96AJ9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VTI1AQ96AJ9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VTI1AQ96AJ9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VTI1AQ96AJ9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VTI1AQ96AJ9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VTI1AQ96AJ9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VTI1AQ96AJ9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VTI1AQ96AJ9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VTI1AQ96AJ9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VTI1AQ96AJ9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VTI1AQ96AJ9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VTI1AQ96AJ9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VTI1AQ96AJ9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VTI1AQ96AJ9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VTI1AQ96AJ9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VTI1AQ96AJ9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VTI1AQ96AJ9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VTI1AQ96AJ9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VTI1AQ96AJ9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VTI1AQ96AJ9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VTI1AQ96AJ9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VTI1AQ96AJ9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VTI1AQ96AJ9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VTI1AQ96AJ9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
VTI1AQ96AJ9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VTI1AQ96AJ9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VTI1AQ96AJ9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
VTI1AQ96AJ9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VTI1AQ96AJ9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VTI1AQ96AJ9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VTI1AQ96AJ9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VTI1AQ96AJ9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VTI1AQ96AJ9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VTI1AQ96AJ9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VTI1AQ96AJ9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VTI1AQ96AJ9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VTI1AQ96AJ9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VTI1AQ96AJ9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VTI1AQ96AJ9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VTI1AQ96AJ9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VTI1AQ96AJ9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VTI1AQ96AJ9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VTI1AQ96AJ9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VTI1AQ96AJ9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VTI1AQ96AJ9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VTI1AQ96AJ9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VTI1AQ96AJ9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VTI1AQ96AJ9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VTI1AQ96AJ9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
VTI1AQ96AJ9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VTI1AQ96AJ9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms